تتميز جهة كلميم واد نون بإمكانات هائلة في مجال الصيد البحري، مما يجعل هذا القطاع أحد الركائز الأساسية للاقتصاد المحلي. تمتد السواحل البحرية للجهة بشكل واسع، حيث توفر بيئات غنية ومتنوعة تعزز من تنوع الأنواع البحرية المتاحة للصيد.
وتتوفر الجهة على ميناءين هما ميناء طانطان وميناء سيدي إفني، يعتبران من بين المراكز الرئيسية للصيد على المستوى الوطني، حيث يفتح ميناء طانطان، الذي يعد من بين أهم موانئ الصيد البحري بالمملكة والثالث على صعيد الأقاليم الجنوبية للمملكة، آفاقا جديدة للنمو الاقتصادي تبعا لقيمة مفرغات السمك بهذه المنشأة.
ويقع ميناء طانطان بجماعة الوطية ويتمثل نشاطه الرئيسي في صيد الأسماك، ويشمل الصيد بأعالي البحار والساحلي والتقليدي بأسطول يزيد عن 650 وحدة تشغل ما ينيف على 12400 بحار، فضلا عن سوق للسمك من الجيل الجديد الذي تم افتتاحه سنة 2015، إلى جانب حوض بناء السفن الذي يصنف من أوائل الأحواض المتخصصة في إصلاح القوارب الساحلية على الصعيد الوطني باستثمار قدره 3 مليار درهم.
أما ميناء سيدي إفني فيعد صيد الأسماك نشاطه الرئيسي والمصدر الأساس للدخل بالمدينة ويلعب دورا محفزا للأنشطة الاجتماعية والاقتصادية بالمنطقة، بتوفره على سوق للسمك ومصنعين للثلج وورش لإصلاح السفن؛ ومنطقة صناعية ومحطة لتوزيع الهيدروكربونات.